[分子科学会速報17-147] 第31回量子系分子科学セミナー

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[分子科学会速報17-147]  第31回量子系分子科学セミナー
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速報発信者:米原丈博(理化学研究所 計算科学研究機構)


第31回量子系分子科学セミナー

第31回量子系分子科学研究セミナーの案内をさせて頂きます.

今回は, 理化学研究所の徳久淳師 先生より,
ゲノム医療分子シミュレーション基盤構築に向けた,
XFELデータ同化による生体高分子構造多形推定に関する研究の
お話を頂きます. ご興味をお持ちの方は是非ご参加下さい.

日時:2018年1月19日(金) 13:30-14:30
場所:理化学研究所 計算科学研究機構 R104会議室
〒650-0047 兵庫県神戸市中央区港島南町7-1-26
http://www.aics.riken.jp/jp/map/

講師: 徳久淳師 氏 (理化学研究所)

題目: ゲノム医療分子シミュレーション基盤構築に向けて
      -XFELデータ同化による生体高分子構造多形推定に関する研究-

要旨:
近年,網羅的な配列解析により効率的に診断し効果的に治療を行う
ゲノム医療が推進されている.我々はゲノム医療のさらなる高度化を目指し,
マルチスケールな分子シミュレーション基盤の構築を進めている.  例えば,
がん疾患に関連が深いクロマチン構造の分子シミュレーションを
実現するには,多様な構造状態を探索する手法の開発が必要となる.
本セミナーでは,Tri-nucleosome系を例に,XFELデータ同化による
生体高分子構造多形推定に関する研究成果を中心に報告する.
加えて,高精度粗視化AI力場開発など分子シミュレーション基盤の
開発方針について述べる.

参考文献:
[1]
“Hybrid approach for structural modeling of biological systems from
X-ray free electron laser diffraction patterns.”
Tokuhisa, A.,Jonic, S., Florence, T., Miyashita. O.,
Journal of structural biology
Volume 194, Issue 3, June, 325-336 (2016).
[2]
“High-speed classification of coherent X-ray diffraction patterns on
 the K computer for high-resolution single bio-molecule imaging”
Tokuhisa A., Arai J., Joti Y., Ohno Y., Kameyama T., Yamamoto. K.,
Hatanaka M., Gerofi B., Shimada A., Kurokawa M., Shoji F., Okada K.,
Sugimoto T., Yamaga M., Tanaka R., Yokokawa M., Hori A., Ishikawa Y.,
Hatsui T. and Go N.
Journal of Synchrotoron Radiation, 20, Part 6, 899-904 (2013)
[3]
“Classifying and assembling two-dimensional X-ray laser diffraction
patterns of a single particle to reconstruct the three-dimensional
diffraction intensity function: resolution limit due to the quantum
noise” Tokuhisa A., Taka J., Kono H. and Go N.
Acta Crystallographica A, 68, 336-381 (2012)

言語:日本語

[ 外部からお越しの方へ ]
入構カードを受け取る必要があります.
量子系分子科学セミナーの参加者である旨を,
次の世話人の名前いずれかと共に受付までお伝えください.
内線 (8441):中嶋隆人 (8447):米原丈博
問い合わせ先: 中嶋 隆人 (nakajima at riken.jp)
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 理化学研究所 計算科学研究機構
 量子系分子科学研究チーム 研究員 米原丈博
 〒650-0047 兵庫県神戸市中央区港島南町7-1-26
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分子科学会速報
発行:分子科学会
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